Münster 1997 – scientific programme

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CP: Chemische Physik

CP 7: Selbstaggregierende Filme, Selbstorganisierende Systeme

CP 7.10: Talk

Wednesday, March 19, 1997, 17:45–18:00, Ger

Analyse von Strukturvorhersagestrategien in einem minimalistischen Modell faltender Heteropolymere — •Martin Ebeling und Walter Nadler — Institut für Theoretische Chemie, Universität Tübingen, Auf der Morgenstelle 8, D-72076 Tübingen

In einem minimalistischen Modell faltender Heteropolymere ist es uns gelungen, ein Ensemble faltender Sequenzen realistischer Länge (L=100) zu erzeugen [1]. An Hand von Ensembles sowohl zufälliger als auch auf Faltung optimierter Sequenzen dieses Modells untersuchen wir die Qualität von Strukturvorhersagestrategien basierend auf (i) der Analyse von Strukturdatenbasen mit Hilfe neuronaler Netze, (ii) der Berücksichtigung ausschließlich lokaler Wechselwirkungen und (iii) der Berücksichtigung ausschließlich tertiärer Wechselwirkungen.

[1] M. Ebeling, W. Nadler, Biopolymers 39 (1996) in press.